医学新视角. 2024;1(4):190-198. (DOI: 10.5582/npjm.2024.01028)
建立并验证缺氧相关基因对模型预测肝细胞癌预后及潜在治疗肝细胞癌小分子药物的筛选
毛树花,黎航,程宗柄,莫增益,冯宇健,杨学伟,宋泽兵
摘要:肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma, HCC)发病率高且预后差。为提高对HCC预后预测的准确性,我们创建了 一种基于缺氧相关基因对(hypoxia-related gene pair, HRGP)的模型。本研究的数据来源是从癌症基因组图谱和国际 癌症基因组数据库获取的HCC患者的临床数据和RNA测序数据,并通过Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO)及单因素COX和多因素COX回归分析构建了预后预测模型。此外我们还构建了一个列线图来帮助预测HCC患 者的总生存期(Overall Surviva, OS)。还进行药物敏感性分析以识别治疗HCC的潜在有效的小分子药物。相比于肿瘤 分级、病理分期和其他三个已发表的预后模型,HRCP预后模型能更准确地预测了HCC的OS。Cox多变量回归分析显 示,HRGP模型的风险评分是HCC OS的独立影响因素。结合风险评分和临床病理分期建立的列线图对OS的预测价值不 低于理想模型。此外我们筛选出五种可能有效治疗低风险患者的小分子药物,而两种药物可能对高风险患者显示出潜 在的疗效。结论:我们创建并验证了一个基于HRGP的模型,能有监测和预测HCC的预后。
关键词: 缺氧相关基因对,肝细胞癌,基于缺氧相关基因对模型,癌症基因组图谱,国际癌症基因组